一、控溫控濕法
將適時采摘的辣椒輕放入專用鮮貯塑料袋或硅窗袋中，每5－10kg裝一袋。同時應注意避免碰倒辣椒。入庫前應在室溫下預冷1－2天，將開始轉紅、有機械操作的辣椒和嫩椒挑出，后放入陰涼的倉室內。堆放時不宜過高過重以防壓壞下面的辣椒，最好應搭架分層分格堆放。同時應使倉室內的溫度控制在5－10℃，相對濕度控制在85％左右，尤其應注意在春天時，倉室內的溫度不能超過8℃，相對濕度不應大于80％。期間做好貯藏檢查管理工作，及時挑選出爛果。
二、砂藏法
首先應選擇比較陰涼的地方，后挖寬1m，深1m，長度不限的溝。并將挖出的土培壘在溝的四周，使溝的總深度在1.3m左右。并在溝底鋪一層3cm厚的選凈了的潮濕細砂，后擺一層辣椒，撒一層細砂將辣椒蓋住，共擺5－6層。再在上面蓋約6cm厚的潮濕細砂，這樣使溝內保持80％左右的相對濕度。最后在溝頂橫放竹竿，在竹竿上放草墊。最初在溝頂橫放竹午，在竹竿上放草墊。最初在白天蓋上草墊，晚上揭去草墊。但隨著溝內溫度的下降，晚上可不再揭草墊，且還要逐漸加厚草墊，以使溝內的溫度保持在5－8℃左右。每隔15天翻動一次，揀選出不宜再繼續貯藏的辣椒上市銷售或自己食用。
三、窖內蓋藏
先挖一個半地下式的貯藏窖，窖的大小可根據貯藏的辣椒量的多少而定。把選好的辣椒裝入墊有紙的竹筐中，放入窖內，后用濕草席圍在竹筐的四周和蓋在筐頂。草席干后要及時噴水，使窖內的相對濕度保持在80％左右，溫度保持在5－8℃。這與砂藏法的要求相同。
用上述幾種方法，可使夏收辣椒貯藏保鮮2個多月左右，秋種冬收的辣椒可貯藏更長的時間，達3個多月。
