1、香菜的凍藏
東北各地多采用地溝凍藏，地溝分活溝和死溝兩種。一般在風障、溫室或立壕北側的遮陽處挖一個寬、深各30厘米或寬70-100厘米，深30-70厘米的活溝。在活溝底順溝長方向挖1-3條寬深各20-25厘米的通風道，通風道峽谷側穿過窖溝的兩端到地面上，通風道上面可稀蔬橫放些單層秫秸，把香菜放在上面貯藏。
供冬藏的香菜，播種期應比直接上市采用松扎袋口的辦法。扎袋時用2厘米粗的木棒插入袋口，扎緊后再抽出木棒，將口邊卷起。貯藏期間不用開袋放風，的晚幾天，收獲期也應晚些，一般在早晚地面結凍，中午融凍時收獲為宜。采收的香菜去掉泥土，摘去黃葉，1-1.5公斤捆成把或撒放在溝內，根身內，葉面撒一層沙土或溝面上蓋一層秫秸，以后隨氣溫下降，分2-3次加覆蓋物，覆土總厚度為20-25厘米。嚴寒的季節可再在上面加蓋草苫，溝內溫度維持在-5-4℃，使香菜葉片凍結，根部不凍為宜，此法可貯到翌年2月底。香菜了出窖后要緩慢解凍，不能急躁。
2、香菜的窖藏
有堆藏和隙藏兩種方式。窖內大量貯藏一般采用堆藏；少量貯藏香菜時一般采用隙藏。
堆藏是將香菜在窖內堆放，堆放的高度一般為25-30厘米。入窖初期，可把香菜堆放在菜窖兩道大門之間的過道里或離窖門、氣窗較近的地方。這里溫度低，便于通風。待氣溫明顯下降以后要移到菜窖內部貯藏。
隙藏就是在窖內白菜縫隙間貯藏香菜。白菜窖內的溫度在0℃左右，而且白菜植株體內含水量較大，這正適合香菜低溫高濕的貯藏條件。這種貯藏方法，在貯藏期間，要控制好窖內溫度，使溫度不能超過5℃，否則香菜葉子容易變黃腐爛。
3、香菜的氣調冷藏
供貯藏的香菜應選棵大、株壯、顏色鮮綠、無病蟲危害的植株。收獲時留根1.5-2厘米長，收獲后勿受熱，及時加工處理，剔除病、傷等黃葉，捆成0.5公斤左右的小捆，上架預冷，在庫溫0℃條件下預冷12-24小時，當香菜體溫達0℃時即可裝袋冷藏，其袋是用聚乙烯薄膜制成，袋長1米，寬0.85米，厚0.08毫米，每袋可裝8公斤香菜。這了方便調節袋內氣體成分，可袋內二氧化碳平均值為7.8左右，氧氣為10.3%左右，商品率和保鮮指數均達90%以上，損耗在7%-8%.松扎袋口貯藏香菜的庫溫，最好恒定在-1.5-1℃，不能過低。這種氣調冷藏，可貯到翌年5月，效果很好。
