去除雜質玉米收獲時往往含有較多的末熟粒、破碎粒、糠屑及穗軸碎塊等雜質，吸濕性強、呼吸量大、帶菌量多、孔隙變小，容易積聚濕熱導致發熱生霉和蟲害，所以玉米收獲后必須過篩除去雜質再入庫貯藏，以確保安全貯藏糧食。
干燥降溫安全貯藏玉米必須控制好水分和溫度條件，根據實踐，玉米含水12.5%，溫度35℃左右，一般能安全貯藏。
玉米收獲后應充分暴曬或烘干處理，使其達到安全水分標準。貯藏中應注意通風散濕，新收獲的玉米更應保持干燥和低濕條、件，才能確保安全。采用“雙低”貯藏，低濕密閉投入、低劑量磷化鋁片與自然降氧貯藏效果良好。
防治病蟲用塑料薄膜壓蒸或密封降氧貯藏不僅可防蟲，同時防濕防毒效果亦好。對已經生蟲的玉米可用過篩或藥物熏蒸法防治。玉米顆粒大，一般害蟲軀體小，采用6孔/寸篩除蟲效果可達80%以上。用磷化氫藥劑熏蒸費用低，殺蟲也比較徹底。北方地區多利用冬季寒冷低溫處理，將糧溫降到0℃以下，趁冷密封，對防治甲蟲和蛾類幼蟲效果良好。
