大蒜的休眠期一般有2～3個月，低溫與干燥是保持休眠的有利條件。大蒜貯藏適宜溫度是-1～-3℃，空氣相對濕度不超過85％，休眠期后，控制零下低溫及干燥的貯藏條件可抑制萌芽及生根。北方大蒜可忍受-7℃低溫，高于5℃易萌芽，高于10℃易爛。溫度過低易使大蒜受凍。
留種大蒜的貯藏條件與食用大蒜不同，可以采取高溫貯藏，以15℃左右室溫，空氣相對濕度不超過70％的干燥條件為宜，這有利于提高大蒜的種性。如果冬季確保穩定的低溫-1-3℃，當播前40天再給予高溫（18～20℃）處理，也能收到同樣效果。
適期收獲是貯存蒜的重要條件。收獲過晚大蒜鱗片易干裂，并促使小芽萌動生成，對貯藏不利。收獲后需給予高溫干燥條件，促使蒜頭迅速干燥及進入休眠。最好曝曬或人工干燥，創造30℃以上的高溫，50％左右的空氣相對濕度，以加速蒜頭干燥。
大蒜的貯藏，多在通風庫內編辮碼或懸掛，少量貯藏可放在冷涼的室內，避免受潮受凍。
