一、短期保鮮。采芽后3—5天不能銷售時，可將椿芽平攤在通風、涼爽的室內席上，厚10厘米左右，切忌堆積生熱，引起腐爛變質。也可按0.5公斤捆成把，基部齊平，豎在木盤或瓷盤中，盤內盛3—4厘米深清水，浸24小時左右，再裝箱外運，可保鮮1周。另一種方法是按0.25—0.5公斤量裝食品袋內，烙封死袋口，放通風涼爽室內，保持5℃以下溫度，可存放10—20天。家庭少量貯存時，可放冰箱內，溫度控制在0—1℃，不使香椿芽受凍。在-2℃—-3℃時，香椿會褪掉絳紅色，凍成暗綠色；呈半透明狀，凍后的香椿口味不佳。
二、較長期保鮮。先將香椿芽捆在保鮮劑中浸一下，拿出晾干，直立或平放在木板箱、多孔塑料箱中，置于0—1℃的冷風恒溫庫中，可保存數月，仍鮮嫩清香。或者向準備存放的香椿芽上均勻地噴灑大蒜素或6-芐基腺嘌呤保鮮劑，然后放入寬50厘米、長40厘米的食品袋內。扎緊袋口。置于0——1℃恒溫庫中貯存。每隔10—15天開袋換氣1次。袋內氧氣含量不低于2%，二氧化碳含量不高于5%。也可將裝有椿芽的條板箱再裝入涂刷硅氧烷混合液的尼龍紗袋中，壓邊密封，可保鮮60天。
